白癜风要注意什么 http://news.39.net/bjzkhbzy/170417/5291513.html当我们刚步入研究生阶段，导师常常会给一个大方向，有的时候会给一个目标基因，让我们自己寻找课题思路。目标基因的下游调控常常已经有比较深入的研究，此时向基因上游寻找方向是个不错的选择。对于科研小白来说，可以从近几年国自然的热点lncRNA角度入手。然而，搜索lncRNA的文献，尤其是肿瘤领域的研究就会发现，满屏都是ceRNA机制的研究，如果这样设计课题，导师一定又会说课题没有创新性了。小编在这里就为你介绍1篇囊括了lncRNA、泛素化修饰、转录因子三大热点的肿瘤研究文章，从头教你如何抛开ceRNA进行肿瘤课题设计。这篇文章今年发表于《CellDeathandDisease》（俗称小CDD，IF=6.），由华中科技大学同济医学院完成，是一篇关于lncRNASNHG12通过干预转录因子蛋白稳定性提高CDCA3表达促进肾细胞癌发展和耐药性的研究。下面我们就来看看这篇文章是如何进行课题设计的吧。一、立项依据肾细胞癌（RCC）是泌尿系统中最常见的恶性肿瘤之一。由于早期症状不明显，肾细胞癌的患者往往在第一次诊断时肿瘤就已经转移。尽管有舒尼替尼（sunitinib）这样的靶向药物能够治疗晚期患者，6-15个月之后患者通常会出现耐药性，严重影响预后和生存率。因此，解析肾细胞癌发展和耐药性的潜在机制有助于改善治疗效果，提高晚期患者的生存率。非编码RNA（lncRNA）是一类长度超过bp、不编码蛋白质的RNA，对基因转录和蛋白质翻译都有重要的调控作用。研究发现lncRNA在肿瘤细胞的增殖转移、凋亡抑制和耐药性方面都具有功能。其中，lncRNASNHG12（本文的主角）被发现能结合microRNA（长度为22bp左右的非编码RNA），起到“分子海绵”的作用，促进肿瘤增殖转移和上皮细胞转化（EMT）；或是参与多种药物耐药性，然而，其分子机制尚不明确。为了解析肾癌细胞对舒尼替尼产生耐药性的具体机制，本文作者开展了以下预实验（即研究基础部分）：（1）通过生物信息学分析筛选参与舒尼替尼耐药性的lncRNA方法：公共数据库（TCGA-KIRC和GEO）结合测序结果首先，作者对三组肾细胞癌和癌旁组织进行RNAseq测序筛选差异表达的lncRNA（这里并没有说明样本的癌组织类型和分期，最好还是说明一下）。然后利用TCGA-KIRC数据库（肾透明细胞癌）筛选肿瘤和正常组织中差异表达的lncRNA，再从GEO数据库中选取对舒尼替尼敏感/耐受的肾细胞癌患者数据集（GSE），分析差异表达的lncRNA，最后取交集，获得4个候选的lncRNA，其中2个在癌组织中上调表达，2个下调表达。（2）进一步数据挖掘，锁定SNHG12方法：On
